内蒙古叫旗是因为清代初期，清政府为了加强对蒙古族的统治，将内蒙古、外蒙古都分成若干单位，而实行军政合一的八旗制度，以不同颜色的旗来区分军队，故称为旗。旗本为满语“固山”的汉名，是清朝八旗兵的最大编制单位，分别有满洲八旗、蒙古八旗和汉军八旗。所以，旗即是行政区划单位，也是军事编制单位，便流传下来，沿用至今。