香港西九龙站实行一地两检的查验模式，主要是在香港西九龙站，由内地和香港的查验部门，由分别按照各自法律，共同实施查验监管。如果北京一名旅客要通过高铁到香港西九龙站，从北京上车一直到西九龙站前，都无须经过出入境检查，可直接到香港西九龙站，在出站后办理出境手续。在此之前，北京、上海、广州等地赴港的普速列车实行两地两检。因此，实行“一地两检”，无疑是方便旅客乘车、提高运输效率的安排。

广深港高铁西九龙站口岸位于香港特别行政区境内，为国际性常年开放铁路客运口岸，于2018年9月23日正式对外开放。高铁西九龙站共有四层地下楼层，总建筑面积为38万平方米。地下一层为售票大厅，地下二层为抵达层，地下三层为离港层，地下四层为列车站台。