之所以松花蛋会有一股类似化肥的味道是因为在制作时是使用的石灰和草木灰，经过强碱作用后，原本具有的含硫胺基酸被分解产生硫化氢及氨，也就是类似化肥的味道。

另外因为松花蛋的蛋黄中有很多蛋白质分解变成了氨基酸，副产出氨化物，分解出少两氨气，氨气有刺鼻性气味，如果松花蛋味道没变仍可食用而且味道比没有刺鼻性气味的蛋更鲜美。