莼菜的病虫害防治工作应注意勤检查、勤观察，一旦甓现，要治得早、治得勤，把病虫草害杀于萌芽状态，确保莼菜旺盛生长。

①青泥苔、椎实螺、杂草的防治。主要靠人工捕捉，结合农药喷杀，方法是用等量式波尔多液，喷洒在青苔、杂草、椎实螺等丛生处，杀死效果较好。

②叶腐病的防治。要保持水质清澄，微流水，施肥时不宜用有机肥，不直接施在叶面上，也可采用波尔多液喷洒叶面防治。

③虫害防治。主要是金花虫（东山称菱叶甲），发生较早，危害较大，成虫黄豆大小，外披鞘壳，暗褐色，有斑，吞食莼叶，并产椭圆形的黄色小卵块，隔3-4天即孵化成幼虫，幼虫也为害莼菜叶片，变态成蛹后即粘附在莼叶上，体呈红色；3天后蛹蜕变成成虫，成虫和幼虫同时为害莼菜浮叶。金花早繁殖力强，约10天左右就能繁殖一代，为害期长、为害量大。根据试验，金花虫发生后每亩用2.5%敌百虫粉3．0公斤泼洒于莼菜叶面，杀虫效果95%，或每亩用杀螟凡0．6公斤，稀释1000倍均匀泼洒于莼菜叶面，杀虫效果85%，另外还可用1200倍的敌敌畏加1500倍的乐果，混合均匀喷洒，效果也较好。