1、经过初加工的白芷用麻袋包装，包件45千克。应贮存于阴凉干燥处，温度不超过30℃，相对湿度70%-75%，商品安全水分12%-14%。本品因含淀粉及挥发油，极易虫蛀、发霉及变色。为害的仓虫有烟草甲、药材甲、米扁虫、咖啡豆象、日本蛛甲、锯谷盗、赤拟谷盗等。如被虫蛀，其根条有明显蛀孔。

2、贮藏期间应定期检查，发现虫蛀、霉变可用微火烘烤，并筛除虫尸碎屑，放凉后密封保藏；或用塑料薄膜封垛，充氮降氧养护。若数量较大，可用磷化铝、氯化苦、溴甲烷熏蒸进行抑菌、杀虫。