马来果龟幼体与成体的外观差距较大，尤其是成体，外观非常的奇特，因为其背甲是扁平的，就像是有人故意在其背甲上捏了一下，看上去既奇怪又很可爱。

　　马来果龟的稚龟，它们拥有着亮黄色至苹果绿色的背甲，是世界上最美丽的幼龟之一。成年的马来果龟可以长到13"(32cm)。这种龟最明显的特征是成体的时候，龟背是平的，上面可以跑汽车!另外一个显著的特征是这种龟有六块椎盾(就是龟背壳中轴线的壳)。所以也有人叫它“六板龟”。绝大多数龟类的椎盾都是五块的。大多数的龟，包括巴西龟、草龟、枫叶龟、缅甸龟、黄喉拟水龟、鹰嘴龟。无一例外都是五块椎盾，所以说算六块椎盾是分辩这种龟最好的方法，就怕数学不过关。

　　马来果龟可以通过扁平背甲上的6或7块椎盾来辨别(所有其他的淡水龟类有5块椎盾)。有一条较低的不连续的脊棱，扁平的背甲呈橄榄色、浅黄褐色或红棕色，稚龟的背甲呈鲜绿色。头部呈褐色，幼体有2条浅黄色的纵纹。腹甲上有不完全的铰链结构，脚趾上有全蹼。除此之外，成年雄性的尾部显得相对更长更粗，腹甲稍显凹陷。