根据法律规定，房屋买卖合同无效后违约金的计算方式是：
1、有约定的按约定；
2、对违约金无约定或约定不明确的，可以协商解决；
3、协商不成，可以向人民法院起诉或向仲裁机构申请仲裁。
4、当事人可以约定违约金的数额，或因违约产生的损失赔偿额的计算方法。违约金过分高于或过分低于损失时，可以请求法院或仲裁机构予以适当减少或增加。