1、注意区分罪与非罪的界限。本罪属于结果犯。只有在行为人因违法发放贷款造成重大损失时，才能以犯罪论处。对行为人的贷款行为没有造成损失或者造成损失不大的，不构成犯罪。
2、划清一罪与数罪。行为人犯本罪时往往兼有以贷谋私，收受贿赂的情形。如果行为人因收受贿赂，数额较大的，同时也构成了受贿罪，应以受贿罪和违法发放贷款罪实行数罪并罚。
3、本罪与违法向关系人发放贷款罪的界限。二者都是金融信贷方面犯罪，犯罪主体相同，犯罪的表现形式也有相似之处。二者的主要区别在于：
(1)在放贷对象方面，违法向关系人发放贷款罪的对象是关系人;本罪的对象是非关系人。
(2)构成犯罪的损失金额不同。违法向关系人发放贷款罪造成较大损失即构成犯罪，而本罪要求造成重大损失才能构成犯罪。