1、机动车撞人后保险公司应当进行赔偿：需要由公安机关确定机动车承担的责任，然后按照责任承担事故的损失赔偿，在赔偿结束以后，按照保险合同条款中投保内容申请保险理赔。理赔时，首先是被保险人向保险公司提交相关资料，保险理赔窗口受理审核，保险公司上级审批同意，保险人最终确定赔偿保险金的数额后，支付相应的赔偿。
2、法律依据：《机动车交通事故责任强制保险条例》
第二十一条 被保险机动车发生道路交通事故造成本车人员、被保险人以外的受害人人身伤亡、财产损失的，由保险公司依法在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内予以赔偿。 道路交通事故的损失是由受害人故意造成的，保险公司不予赔偿。