非法携带毒品原植物种子罪立案的标准是：
1.行为人携带罂粟种子五十克以上、罂粟幼苗五千株以上；
2.行为人携带大麻种子五十千克以上、大麻幼苗五万株以上；
3.行为人携带其他毒品原植物种子、幼苗数量较大的情形。