公司破产清偿债务的程序是：

1、破产费用。包括：破产案件的诉讼费用;管理、变价和分配债务人财产的费用;管理人执行职务的费用、报酬和聘用工作人员的费用。

2、共益债务，是指人民法院受理破产申请后，为了全体债权人的共同利益以及破产程序顺利进行而发生的债务。共益债务包括：

(1)因管理人或者债务人请求对方当事人履行双方均未履行完毕的合同所产生的债务;

(2)债务人财产受无因管理所产生的债务;

(3)因债务人不当得利所产生的债务;

(4)为债务人继续营业而应支付的劳动报酬和社会保险费用以及由此产生的其他债务;

(5)管理人或者相关人员执行职务致人损害所产生的债务;

(6)债务人财产致人损害所产生的债务。

3、破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，依照下列顺序清偿：

(1)破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金;

(2)破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款;

(3)普通破产债权。

此外，破产财产不足以清偿同一顺序额清偿要求的，按比例分配。

另外，已作为银行贷款等债权的抵押物或者其他担保物的财产，一般不能作为清偿的财产。因为，作为抵押物或者其他担保物的财产在债务人不能履行义务时，实际上已转换成债权人的财产。债务人已不能对它们再行使权利。因此，民事诉讼法规定，已作为银行贷款等债权的抵押物或者其他担保物的财产，银行和其他债权人享有就该抵押物或者其他担保物优先受偿的权利。抵押物或者其他担保物的价款超过其所担保的债务数额的，超过部分属于破产还债的财产。

公司申请破产受理以后会成立专门的清算小组来对债务进行处理，清算小组需要根据债务清偿的顺序来进行偿还债务，首先需要偿还的就是员工的工资等相关的费用，然后需要清偿的是社会保险费和所欠税款等等，最后再是普通债权。