125摩托车使用的发动机都是四冲程汽油发动机，这种发动机的工作原理与汽车的发动机是相同的。
四冲程汽油发动机在工作时有四个冲程，分别是吸气冲程，压缩冲程，做功冲程，排气冲程。
发动机处于吸气冲程时，进气门会打开，此时活塞会向下运行吸入可燃混合气。
发动机处于压缩冲程时，进排气门都会关闭，此时活塞会向上运行压缩可燃混合气。
发动机处于做功冲程时，进排气门都会关闭，此时火花塞会点燃可燃混合气，燃烧的可燃混合气会向下推动活塞，这样发动机就可以输出动力了。
发动机处于排气冲程时，排气门会打开，此时活塞会向上运行将燃烧产生的废气排出。
四冲程发动机在工作时会不断循环这四个冲程。
125摩托车的发动机都是单缸的，有些摩托车会使用更大排量的发动机，并且会使用多缸发动机。
多缸发动机的运转平顺性是更好的。
