伊犁鼠兔习惯群居，挖洞或利用天然石隙群栖。白天活动，常发出尖叫声，以短距离跳跃的方式跑动；不冬眠，有储备食物的习惯，当冬天来临时，依赖所储备的食物过冬；为草食性动物，多以金莲花、虎耳草、雪莲等高山植物为食。