农村合作医疗是有大病保险的。

新农合参保人员因病去指定医疗机构治疗所花费的医疗费用在经过新农合报销之后，对于因特殊情况超过规定限额以上的、需要个人负担的费用中的合规医疗费用，就还可以通过大病保险这一项目来给予补偿。

不过费用必须得达到大病保险起付线，才能进行补偿。而因为社保是分地区统筹的，所以不同的地区，新农合大病保险的起付线也可能会有所差别。但通常都是1万元左右的样子。而普通人群和低五保人员的起付线也会有所不同。

还有，所患病种、所用药物不同，补助比例也是不同的。而治疗的医院不同，补助比例也会不同。且在补助的时候就还需要注意，大病保险采取的是分段补助的方式。若是不清楚具体规定的话，可以去咨询一下当地社保中心的工作人员。