南京城乡医保重复缴纳主要有两种原因：
一是手机缴费时，系统原因造成重复扣费，银行对账后会在三个工作日内原路退还多缴费用，缴费人无需操作；
二是按照不同身份缴纳了同一年度城乡居民医保，可以拨打12366进行核实，符合要求可按规定办理多缴社保退费。
拓展阅读：非南京户籍新生儿如何办理参保？
非本市户籍新生儿，在上完户口后去居住地的公安部门给新生儿办理南京居住证，然后携带孩子户口本、社保卡、出生证明、父母身份证、孩子居住证、父母一方参加南京社保的参保证明等材料至街道(镇)和社区(村)社保基层经办机构办理。
