1、分居期间房贷仍由夫妻共同偿还。因为只是分居并未离婚，无论因为什么而分居，也不管分居达到多长时间，只要双方未办理离婚手续，婚姻关系就依法存在，婚姻关系存续双方就对共同债务负有偿还的责任。
2、法律依据：《民法典》
第一千零八十九条 【离婚时夫妻共同债务清偿】
离婚时，夫妻共同债务应当共同偿还。共同财产不足清偿或者财产归各自所有的，由双方协议清偿;协议不成的，由人民法院判决。