三年不同居可以协议离婚,如果协议离婚不成可以通过法院诉讼途径离婚。

第一，协议离婚程序：1、双方先亲自到一方户口所在地的婚姻登记管理机关申请离婚登记。2、婚姻登记机关审核，通过则发放离婚证。3、当事人从取得离婚证起，解除夫妻关系。

第二，诉讼离婚程序：1、先自行写好或者请律师代写离婚起诉书。2、准备诉讼离婚所需要的证据。3、向有管辖权的法院递交离婚起诉书和证据。4、法院决定是否受理该离婚诉讼。5、法院受理该离婚诉讼案件之后，在法定时间内向对方发送起诉书副本。6、当事人参加庭审，等待法院审判。7、法院作出准予离婚或者不准予离婚的判决。

【法律依据】

《民法典》第一千零七十六条规定，夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。（《民法典》生效时间为2021年1月1日）